我国科研团队创新空间蛋白质组学:PLATO技术引领生命科学研究新篇章

   时间:2025-02-06 20:02 来源:ITBEAR作者:沈瑾瑜

近日,中国科学院动物研究所赵方庆团队在权威科学期刊《Cell》上发表了一项突破性研究成果。该团队开发了一种名为PLATO的全新空间蛋白组学技术框架,为复杂组织的蛋白质空间分布研究开辟了新路径。

PLATO技术融合了人工智能深度学习算法与微流控技术,实现了前所未有的全组织切片水平高分辨率空间蛋白质组检测。据了解,该技术能够达到25微米的分辨率,并能同时检测数千种蛋白质,这一成就突破了高通量原位组学技术的传统瓶颈。

传统的空间蛋白质组方法主要依赖于抗体染色或质谱技术。然而,抗体染色方法受限于靶标数量,通常只能检测几十至几百种蛋白分子;而质谱技术虽然检测种类丰富,但其逐点取样的方式却大大增加了实验成本和规模。PLATO技术的出现,则有效解决了这些问题。

PLATO技术从断层扫描成像的重构原理中汲取灵感,通过降维后的平行流投影与深度学习算法Flow2Spatial的结合,成功重构出蛋白质的高分辨率空间分布。Flow2Spatial算法运用自编码器模型,将平行流投影的实验过程模拟为“降维编码”,并通过整合组织学染色、空间转录组学等其他空间组学数据,对蛋白质空间分布进行高精度“升维解码”。

这一原创算法的突破,不仅克服了传统技术难以获取空间信息的限制,还显著提高了空间蛋白质组的覆盖度和分辨率。PLATO技术的成功应用,为解析其他组学分子的空间分布提供了全新的解决方案,有望推动生命科学研究领域的深入发展。

值得注意的是,PLATO技术深度融合了人工智能算法、微流控和质谱技术,展现了跨学科合作的强大力量。随着技术的不断迭代和创新,PLATO有望成为生命科学研究领域的重要工具,为科研人员提供更多、更精准的实验数据和分析手段。

 
 
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